การออกแบบวัคซีนเอชไอวีควรปรับเปลี่ยนเมื่อเอชไอวีกลายพันธุ์

เป็นที่ทราบกันดีว่าไวรัสภูมิคุ้มกันบกพร่องของมนุษย์เป็นไวรัสที่มีความผันแปรสูงซึ่งปรับให้เข้ากับการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันของบุคคลในระหว่างการติดเชื้อตลอดชีวิต และการศึกษาใหม่ที่ตีพิมพ์ในวารสาร Nature Medicine แสดงให้เห็นว่าการปรับตัวของไวรัสในเอชไอวีสามารถทำนายสถานะของโรคในปัจจุบันของบุคคลได้ เช่นเดียวกับระดับ ซึ่ง HIV-1 ที่แพร่เชื้อใหม่จะถูกปรับให้เข้ากับโฮสต์ใหม่ ด้วยการใช้วิธีการใหม่ในการวัดขอบเขตของการปรับตัวของไวรัสต่อการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันของเซลล์ ผู้วิจัยสามารถคาดการณ์ได้ว่าโรคจะดำเนินไปอย่างรวดเร็วเพียงใดในบุคคลนั้น วัคซีน แขนระดับเซลล์ของการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันผ่าน CD8+ T-cells จะกำจัดเซลล์ที่ติดเชื้อ HIV ทีเซลล์เหล่านี้ถูกกระตุ้นโดยชิ้นส่วนของไวรัส ซึ่งเป็นเปปไทด์อีพิโทป ซึ่งนำเสนอบนโปรตีนแอนติเจนของเม็ดโลหิตขาวของมนุษย์บนพื้นผิวของเซลล์ที่สร้างแอนติเจน HLA เป็นโปรตีนที่ผิวเซลล์ซึ่งเป็นหนึ่งในส่วนที่แปรผันได้หลากหลายที่สุดของจีโนมมนุษย์ ซึ่งมีลักษณะเฉพาะเช่นเดียวกับ DNA ของแต่ละคน การกลายพันธุ์ที่เกิดขึ้นเองบางอย่างใน HIV จะเปลี่ยน epitopes ซึ่งเป็นแอนติเจนที่ T-cell จับอยู่ ดังนั้นโปรตีน HLA จึงไม่สามารถนำเสนอพวกมันได้อย่างมีประสิทธิภาพอีกต่อไป และไม่กระตุ้นการตอบสนองของภูมิคุ้มกันอีกต่อไป กระบวนการปรับตัวของไวรัสนี้เกิดขึ้นอย่างต่อเนื่อง และการดัดแปลงบางอย่างจะคงอยู่แม้หลังจากการแพร่เชื้อตามลำดับไปยังบุคคลใหม่ ทีมงานนานาชาติที่นำโดยนักวิทยาศาสตร์จาก Microsoft Research, University of Alabama at Birmingham และ Emory University ใช้แบบจำลองเพื่อหาปริมาณการปรับตัวของไวรัส ซึ่งแสดงให้เห็นว่าการติดเชื้อจากไวรัสที่ปรับตัวสูงต่อการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันนั้นส่งผลเสียอย่างมากต่อบุคคลนั้น Jonathan Carlson, Ph.D., นักวิจัยอาวุโสของ Microsoft Research กล่าวว่า "บุคคลที่โชคไม่ดีที่ติดเชื้อไวรัสที่ดัดแปลงล่วงหน้าจะมีค่า CD4 ต่ำเร็วขึ้น 3 เท่า และมีปริมาณไวรัสสูงขึ้นมาก"